Les organes de la CFLEDD sont :

Au Niveau National :

• L’assemblée Générale
• Conseil d’administration
• Commissaires aux comptes ;
• Coordination Nationale ;
• Conseil de discipline et des sages cet organe fonctionne pour le cas spécifique et non de manière permanente

Au Niveau Provincial :

• Coordination Provinciale/point focal provincial.
• Points focaux territoriaux

Tous les membres des différents organes de la CFLEDD sont collégialement solidaires et veille sur une bonne marche de la CFLEDD. Dans ce contexte, les membres de ces organes travaillent selon le principe de la promotion des relations inter-organes plus conviviales de la base au sommet.

La CFLEDD a définie son organisation avec la création des axes clés pour son fonctionnement qui sont :

• Foncier, Aménagement du territoire et Démographie;
• Agriculture durable et forêts ;
• IEC et Plaidoyer
• Savoirs endogènes
• Genre